Durante a decomposição natural dos dejetos, é liberado metano, um gás com potencial de efeito estufa 21 vezes maior que o gás carbônico. Com o uso do biodigestor, esse metano é capturado e queimado como fonte de energia. Ao ser queimado, ele é convertido em gás carbônico, uma forma muito menos agressiva ao meio ambiente. Ou seja, o biodigestor contribui para a redução do aquecimento global, ao substituir a emissão de metano por gás carbônico  ou em outras palavras, transforma um problema ambiental em uma solução energética.